Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms