Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD83Q01151 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CD83Q01151 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms