Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MDM2Q00987 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms