Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.5 ms