Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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