Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMC1P62191 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms