Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms