Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF6P49848 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF6P49848 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms