Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDF5P43026 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDF5P43026 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms