Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMPOP42166 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMPOP42166 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
TMPOP42166 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMPOP42166 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMPOP42166 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms