Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MLH1P40692 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MLH1P40692 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms