Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms