Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHRNA7P36544 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms