Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms