Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL9P32969 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL9P32969 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL9P32969 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL9P32969 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL9P32969 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL9P32969 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL9P32969 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL9P32969 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL9P32969 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL9P32969 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms