Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP1P29466 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP1P29466 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP1P29466 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP1P29466 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP1P29466 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP1P29466 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP1P29466 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms