Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA5P28066 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PSMA5P28066 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMA5P28066 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms