Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms