Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms