Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM21P19474 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms