Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms