Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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