Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKAP2O75563 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms