Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms