Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLDN25C9JDP6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLDN25C9JDP6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLDN25C9JDP6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLDN25C9JDP6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLDN25C9JDP6 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLDN25C9JDP6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLDN25C9JDP6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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