Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HMGB1P1B2RPK0 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms