Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C4orf47A7E2U8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms