Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms