Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIC3Q9UHC3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms