Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms