Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms