Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM30AQ9NV96 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms