Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPJQ9HC77 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms