Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf49Q9H6J7 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms