Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms