Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC8Q9BY41 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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HDAC8Q9BY41 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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HDAC8Q9BY41 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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HDAC8Q9BY41 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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