Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOL6Q9BWW8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOL6Q9BWW8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms