Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PI4K2AQ9BTU6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms