Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms