Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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