Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms