Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPBP1Q92547 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms