Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD6Q92537 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms