Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEDD1Q8NHV4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms