Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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TMIEQ8NEW7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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TMIEQ8NEW7 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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TMIEQ8NEW7 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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TMIEQ8NEW7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TMIEQ8NEW7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TMIEQ8NEW7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TMIEQ8NEW7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TMIEQ8NEW7 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TMIEQ8NEW7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TMIEQ8NEW7 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TMIEQ8NEW7 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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