Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYW5

RNF168, E3 ubiquitin-protein ligase RNF168, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF168Q8IYW5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF168Q8IYW5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF168Q8IYW5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF168Q8IYW5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF168Q8IYW5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RNF168Q8IYW5 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNF168Q8IYW5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNF168Q8IYW5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNF168Q8IYW5 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNF168Q8IYW5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNF168Q8IYW5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNF168Q8IYW5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF168Q8IYW5 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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