Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms