Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP34Q70CQ2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms