Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms