Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms